本學程設立之主要目的包括:資訊技術與醫學研究跨領域的融合、醫學資訊的研發人才之培育、醫學資訊新興產業技術團隊的育成。本學程發展重點是有鑑於資訊工程及資訊科學之基礎知識與技術已臻成熟，二十一世紀之挑戰及目標將是「應用與服務」，而生技醫療更是全球性之未來重要發展領域。為因應此趨勢，本學程發展目標在於致力培育新一代醫學資訊科技應用人才，積極研究及開發醫學資訊之軟/硬體相關技術，結合國內產官學研之各項資源，並與國際接軌，提升國內醫學資訊產業技術。

    台灣目前已進入高齡社會，且將於2025年邁向超高齡社會，在人力資源缺乏且科技資訊進步的時代，醫療健康產業勢必要導入智慧化資訊科技，才能提升醫療效率。全球資通訊產業（Information and Communication Technology, ICT），積極佈局健康產業，造就醫療健康照護產業的轉變。為達成台灣2030全齡健康願景，對於醫療健康產業跨領域人才培育是刻不容緩。

    醫療健康產業面臨著多種挑戰，生成式人工智能是一個快速發展的生態系統工具，將以前所未有的方式改變醫療健康產業，解決這些挑戰，本學程目標即是要培養具備數位科技核心能力兼具健康創新應用之跨領域人才；將以清華大學深厚的醫學研究基礎、跨領域整合大數據、AI人工智慧與機械等優勢，培育新世代雙專長醫師人才，落實跨領域科技應用。

    本學位學程有四大發展方向：

（一） 發展臨床醫學資訊學(Clinical Informatics)之應用與研究課題。

（二） 發展遠距醫療(Telemedicine) 之應用與研究課題。

（三） 發展臨床試驗(Clinical Trial)之應用與研究課題。

（四） 發展人工智能(AI)在醫療健康領域之應用與研究課題。